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Déterminants génétiques de la résistance aux antibiotiques dans les sous-espèces diarrhéiques de Klebsiella Pneumoniae ozaenae: un entéropathogène émergent au Sénégal

Le mécanisme moléculaire de sa pathogenèse reste incertain. Des facteurs de virulence incluant les fimbriae, les systèmes d’absorption du fer, le lipopolysaccharide, le sérotype capsulaire et les toxines impliquées dans la pathogénicité de Klebsiella pneumoniae ont été observés sur des régions d’ADN acquises horizontalement, comme les îlots pathogènes, les plasmides, les transposons et bactériophages La transmission horizontale de gènes entre bactéries, y compris les gènes de résistance aux antimicrobiens, peut également se produire par transduction, transformation ou conjugaisonNous rapportons ici les déterminants génétiques de la résistance et de la virulence chez K pneumoniae sous-espèce ozaenae isolées au Sénégal Nous avons isolé des souches de K pneumoniae Le premier isolat a été obtenu en janvier auprès d’une personne infectée par le virus de l’immunodéficience humaine, le second en mai d’un cancer humain. immunodéficience patient infecté par un virus de type y avec un compte de lymphocytes CD & lt; cellules / mm Ces sujets ont été sélectionnés au hasard pour faire partie d’une étude cas-témoins. La pneumonie de K sous-espèce ozaenae était considérée comme le seul agent étiologique de la diarrhée car elle était obtenue en culture pure dans des souches non sélectives, solides, bromocrésol-violet. avec le système API E Biomérieux La sensibilité aux antibiotiques a été testée par diffusion sur disque, selon les recommandations du Clinical Standards Laboratory LaboratoryStrains résistantes à la concentration minimale inhibitrice de l’amoxicilline [MIC], μg / mL, acide amavicilline-acide clavulanique, μg / mL, ticarcilline MIC , μg / mL, CMI de triméthoprime-sulfaméthoxazole, μg / mL, CMI de tétracycline, μg / mL, CMI de chloramphénicol, & gt; μg / mL, CMI d’ofloxacine, μg / mL et CMI de la ciprofloxacine, μg / mL. Aucune β-lactamase à spectre étendu n’a été détectée. Cette résistance aux tétracyclines de première intention et au triméthoprime-sulfaméthoxazole et aux quinolones de deuxième ligne et l’absence de une β-lactamase à spectre étendu permet l’utilisation de céphalosporines à large spectre pour traiter les maladies diarrhéiques dans ces cas. L’ADN a été extrait à l’aide d’un kit Qiagen, selon les recommandations du fabricant, et stocké à – ° C Polymerase en chaîne PCR pour la détection antimicrobienne des gènes de résistance et des intégrons ont été réalisés avec des amorces décrites ailleurs. Les gènes AB, FJ, AY et X blaTem, cat, tetB et qnrS codant pour la résistance à l’ampicilline, au chloramphénicol, à la tétracycline et aux quinolones étaient présents dans tous les souches Les deux souches hébergées classon et classe integron La caractérisation de l’intégron de classe a révélé un tableau de cassettes atypique avec une séquence d’insertion, oxa-aadA-IS In c Le segment était absent dans les intégrons de classe. L’intégron de classe atypique oxa-aadA-IS a été décrit dans le locus de résistance de Shigella dans le cas des intégrons de lassions, l’organisation des réseaux de cassettes a révélé les mêmes cassettes que celles trouvées dans Tn dfrA- sat-aadA-orfX. La présence de la même teneur en intégrons chez les espèces de Shigella suggère que les isolats de la sous-espèce K pneumoniae peuvent avoir acquis l’intégron de la classe atypique par transfert horizontal avec d’autres déterminants de la résistance. ; transfert de conjugaison, qui nécessite un contact cellule à cellule, facilitant le flux de gènes dans le tractus gastro-intestinalPour déterminer si les déterminants de résistance étaient transférables, nous avons réalisé une expérience conjugative sur un milieu sélectif contenant de l’acide nalidixique μg / mL plus triméthoprime μg / mL Tous antimicrobiens les résistances médicamenteuses ont été transférées à la fois de la sous-espèce K pneumoniae ozaenae à une souche E coli résistante à l’acide nalidixique. L’analyse plasmidique a révélé que les isolats et les transconjugants contenaient un seul plasmide de & gt; L’analyse par PCR de l’ADN plasmidique et des transconjugants a confirmé le transfert de tous les gènes de résistance et des intégrons de classe et de classe, suggérant la localisation plasmidique de ces déterminants résistants.C’est la première description de K pneumoniae sous-espèce ozaenae associée à la diarrhée au Sénégal. un cas de diarrhée sanglante causée par K pneumoniae mais n’a pas trouvé de gènes de virulence et a présenté la possibilité de la présence de nouveaux gènes de virulence Le système d’absorption du dicitrate fec dans les espèces Shigella est connu pour jouer un rôle important dans la virulence bactérienne. Le système de transport du dicte ferrique était impliqué dans la virulence de K pneumoniae sous-espèce ozaenae, nous avons réussi la PCR avec utilisation des amorces décrites par Pan et al Parce que tous les marqueurs pertinents de l’îlot de pathogénicité du locus de résistance Shigella étaient présents dans la sous-espèce K pneumoniae pensé qu’un transfert de gène horizontal, un processus qui est bien connu pour contribuer à l’évolution microbienne, aurait pu se produire entre Shigella et K pneumoniae

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Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: pas de conflits

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