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Distribution de clones pneumococciques à la pénicilline non sensibles dans la région métropolitaine de Baltimore et variables associées à la pharmacorésistance

Nous avons évalué la distribution des groupes clonaux comme déterminé par électrophorèse en champ pulsé de Streptococcus pneumoniae non pénicillinique qui a provoqué une infection pneumococcique invasive dans la région métropolitaine de Baltimore pendant et bien que S pneumoniae ait causé une maladie invasive chez des individus de divers groupes et endroits démographiques. les souches isolées au cours de la saison où les infections respiratoires sont les plus fréquentes étaient plus susceptibles de provenir de groupes clonaux associés à la résistance à la pénicilline que d’autres groupes

publié ailleurs , nous avons décrit les groupes clonaux de PNSP qui ont causé une maladie invasive à Baltimore au cours d’une période de 1 an Dans la présente étude, nous analysons la distribution de ces groupes clonaux pour déterminer si la variation observée dans PNSP pourrait être la Méthode de surveillance active des infections pneumococciques invasives en laboratoire dans la région métropolitaine de Baltimore BMA en janvier dans le cadre de la maladie invasive bactérienne du Maryland, à la suite de la circulation de souches différentes au sein de certaines populations, dans certaines zones géographiques et à un moment particulier de l’année. Projet de surveillance BIDS La définition de cas dans le BIDS est l’isolement de S pneumoniae à partir d’un fluide corporel normalement stérile d’un résident BMA de tout âgeThe BMA, qui a une population de millions d’individus, comprend Baltimore City BC et Baltimore, Anne Arundel, Comtés de Carroll, Harford et Howard Tous les hôpitaux de soins actifs de la BMA participent au BIDS, tout comme les autres Laboratoires d’obiologie qui traitent les hémocultures Pour chaque cas éligible, le professionnel de contrôle des infections de l’hôpital remplit un formulaire de rapport de cas contenant des informations démographiques et cliniques. L’isolat pneumococcique est soumis à une confirmation d’espèce et à des tests de sensibilité Toutes les souches pneumococciques isolées du sang, à l’exception de chacune des isolats de liquide articulaire, du liquide céphalorachidien et du liquide pleural S pneumoniae avec une pénicilline CMI comprise entre et μg / mL ont été considérées comme «intermédiaires de la pénicilline» et celles avec une pénicilline MIC ≥ μg / mL Les souches de pénicilline-intermédiaire et résistantes à la pénicilline ont été incluses collectivement dans le groupe «PNSP» PFGE a été effectuée, en utilisant l’enzyme de restriction «résistante à la pénicilline» Isolats avec une pénicilline MIC μ μg / mL étaient considérés comme «sensibles à la pénicilline» SmaI, et les résultats ont été analysés comme décrit ailleurs Les données ont été analysées par utilisation de Epi Info, version Centres de prévention et de contrôle des maladies Le test and et le test exact de Fisher ont été utilisés pour l’analyse des variables catégorielles Variables incluses race blanc et noir, groupe d’âge -, – et ≥ ans, saison saison des infections respiratoires, novembre- Avril; la saison des infections non respiratoires, mai-octobre, et la localisation géographique de la résidence urbaine et suburbaine «urbaine» a été définie comme BC, et «suburbain» a été défini comme les juridictions restantes dans le BMAT pour s’assurer que le nombre de souches que nous avons examiné était suffisant pour analyse significative, nous avons limité notre analyse aux groupes clonaux qui comprenaient au moins des souches Le sérotype est étroitement associé au groupe clonal et à certaines des variables démographiques que nous avons examinées, par exemple, l’âge et, par conséquent, est une variable confondante. groupe avec groupe clonal% des souches dans ces groupes étaient de sérotype V et groupe clonal avec groupe clonal% des souches dans ces groupes étaient de sérotype F Résultats Les données d’un total de patients avec infection pneumococcique invasive ont été rapportées de janvier à Décembre Des isolats pneumococciques étaient disponibles pour% des cas chez le même nombre de patients, et parmi ceux-ci, les souches% et% se sont avérées être pénicilline intermédiaire et résistante à la pénicilline, respectivement Des isolats de PNSP,% étaient disponibles pour le sérotypage et PFGE Parmi ces isolats,% des souches ont été identifiés comme faisant partie de groupes clonaux – Aucune des autres souches ne faisait partie de groupes clonaux moins de souches et pour lesquelles un groupe clonal de comparaison incluant également au moins des souches a pu être trouvé Par exemple, le groupe clonal était constitué de souches de sérotype A; Cependant, les souches restantes du sérotype A appartenaient à différents groupes clonaux coaguler. En revanche,% du groupe clonal et des souches étaient du sérotype V, et tous les groupes clonaux et souches étaient du sérotype FOf les souches dans le groupe clonal,% étaient la pénicilline résistante, comparée à% des souches dans le groupe clonal P μ De même, toutes les souches du groupe clonal, comparées à% des souches du groupe clonal, étaient résistantes à la pénicilline P μ Presque% des patients ayant des souches clonales le groupe a développé l’infection pendant la saison des infections respiratoires, comparé à% des patients qui avaient des souches dans le groupe clonal P =; Une tendance similaire a été observée pour les groupes clonaux et: les souches du groupe clonal étaient plus fréquentes que celles du groupe clonal pendant la saison des infections respiratoires. Les chances d’avoir une infection causée par une souche dans un des groupes clonaux associés à la pénicilline Les souches des groupes clonaux associés à des souches clonales résistantes à la pénicilline ont été observées dans tous les groupes d’âge, chez les individus noirs et blancs et dans les zones urbaines et côtières. zone suburbaine figure et table

Tableau View largeDownload slideDistribution de groupes clonaux de Streptococcus pneumoniae à la pénicilline non-sensible dans la région métropolitaine de Baltimore, selon certaines variables démographiquesTable View largeTélécharger slideDistribution de groupes clonaux de Streptococcus pneumoniae non pénicillin-non-sensible dans la région métropolitaine de Baltimore, selon certaines variables démographiques

Figure vue largeTaille de diapositive Profils d’électrophorèse en champ pulsé, groupe d’âge en années, race, résidence, saison d’infection et résistance à la pénicilline de l’isolat infectieux pour les individus infectés par des souches de Streptococcus pneumoniae de groupes clonaux et B, Black; Moi, intermédiaire; NONRESP, saison des infections non respiratoires; PCN, résistance à la pénicilline; R, résistant; RESP, saison des infections respiratoires; W, whiteFigure View largeTélécharger diapositive Profils d’électrophorèse en champ pulsé, groupe d’âge en années, race, résidence, saison d’infection et résistance à la pénicilline de l’isolat infectieux pour les individus infectés par des souches de Streptococcus pneumoniae de groupes clonaux et B, Black; Moi, intermédiaire; NONRESP, saison des infections non respiratoires; PCN, résistance à la pénicilline; R, résistant; RESP, saison des infections respiratoires; W, whiteDiscussion Dans les études publiées ailleurs, race blanche chez les enfants, résidence de banlieue , et la saison des infections respiratoires ont été associés à PNSP Dans la présente étude, nous avons examiné l’association entre certains des groupes clonaux de PNSP dans la BMA et les variables démographiques et saisonnières qui ont été associées au PNSP À notre connaissance, il s’agit de la première étude qui a tenté de réconcilier les profils observés de résistance aux médicaments avec la distribution des clones PNSP dans une population définie. la saison des infections respiratoires dans la BMA, les groupes clonaux associés aux souches résistantes à la pénicilline étaient plus fréquents que durant le reste de l’année et étaient plus communs que les groupes clonaux associés aux souches intermédiaires de pénicilline. Ce phénomène n’a pas été décrit ailleurs et fournit un aperçu supplémentaire sur la saisonnalité de S pneumoniae résistant à la pénicilline chez les personnes atteintes d’une infection pneumococcique invasive Les groupes clonaux ont circulé sans différence entre les individus blancs et les individus noirs, les adultes et les enfants, et les résidents des zones urbaines et des banlieues la preuve que l’utilisation d’antibiotiques est considérablement plus élevée pendant la saison des infections respiratoires suggère que la pression antibiotique influence la distribution des groupes clonaux associés à la résistance à la pénicilline La présente étude a plusieurs limites. Premièrement, notre analyse portait sur les souches des sérotypes F et V inclus toutes les souches PNSP; cependant, pour assurer une taille d’échantillon adéquate et pour tenir compte de la confusion potentielle par sérotype, nous avons choisi les groupes clonaux qui avaient au moins des souches et ont été appariés par sérotype En raison de la diversité génétique des autres souches PNSP , la plupart des autres groupes clonaux Deuxièmement, bien que les études épidémiologiques sur le PNSP comparent souvent les souches sensibles à la pénicilline aux pénicillines non sensibles, nous avons comparé la pénicilline intermédiaire avec des souches résistantes à la pénicilline. Cependant, nous ne croyons pas que cette limitation affecte considérablement nos résultats. Malgré ces limites, nos données ont des implications importantes pour les programmes visant à réduire l’utilisation inappropriée des antibiotiques. Nous avons observé une corrélation entre les changements saisonniers dans l’utilisation des antibiotiques et les groupes clonaux. suggère que la fréquence des clones résistants peut être sensée En conséquence, en théorie, une utilisation plus judicieuse des antibiotiques pourrait entraîner une réduction de la pharmacorésistance en raison de la diminution de la fréquence des infections invasives causées par des clones pneumococciques hautement résistants .

Remerciements

Nous remercions les praticiens de contrôle des infections hospitalières et le personnel de laboratoire de microbiologie de la région métropolitaine de Baltimore qui ont participé à l’identification des cas de pneumocoques et à la fourniture des isolats bactériens; Yvonne Dean-Hibbert et Jackie Hunter, Université Johns Hopkins, Baltimore, pour leur aide à la surveillance; Kim Holmes Johns Hopkins University, pour son aide à la collecte de données; Nous remercions Victor Yu Université de Pittsburgh pour son expertise et David McDevitt Université de Pittsburgh pour les tests de sensibilité des isolats sélectionnés Nous remercions Terry Thompson et Lashondra Shealey Centres pour le contrôle et la prévention des maladies, Atlanta, pour une assistance dans le test du sérotype d’isolats sélectionnés; Linda McDougal Centres pour le contrôle et la prévention des maladies, pour fournir les modèles de susceptibilité des clones pneumococciques internationaux; Jim Jorgensen Université du Texas Health Sciences Center, San Antonio, pour effectuer des tests de sensibilité; Nous remercions également le projet Emerging Infections du Maryland, en particulier Dale Rohn, John Sweitzer et Jeff Roche, ainsi que le personnel du programme d’épidémiologie et de lutte contre les maladies du Maryland Department. de la Santé et de l’Hygiène Mentale, pour leur soutien Nous remercions chaleureusement Anne Schuchat des Centres pour le Contrôle et la Prévention des Maladies pour son examen réfléchi

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