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Bactériologie changeante de l’abcès du poumon adulte communautaire à Taïwan: Klebsiella pneumoniae versus Anaerobes

Contexte La plupart des publications sur l’abcès pulmonaire se concentrent sur les abcès pulmonaires bactériens anaérobies et les infections bacillaires gram négatif aérobies sont moins souvent discutées. Cette étude visait à étudier la bactériologie des abcès pulmonaires acquis dans la communauté et à améliorer la stratégie thérapeutique empirique chez les adultes ayant des problèmes communautaires. Nous avons examiné et analysé des données sur des cas adultes consécutifs d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté bactériologiquement confirmés traités dans un hôpital universitaire de Taiwan. Résultats Nous avons trouvé qu’une forte proportion de cas d’abcès pulmonaires étaient dus à une infection à Klebsiella pneumoniae. diffère des résultats d’études antérieures L’abcès pulmonaire dû à K pneumoniae était associé au rapport de risque diabétique sous-jacent [OR]; % intervalle de confiance [CI], -; P = et négativement corrélé avec un délai entre l’apparition des symptômes et le diagnostic de & gt; jours OU,; % CI, -; P = Un pourcentage plus élevé de patients atteints d’un abcès pulmonaire à K pneumoniae avait une bactériémie concomitante OU; % CI, -; P =, défervescence retardée OU,; % CI, -; P =, et plusieurs cavités notées sur les radiographies OU; % CI, -; P =, comparé aux patients ayant un abcès pulmonaire bactérien anaérobie Le taux de non-susceptibilité à la clindamycine et à la pénicilline parmi les anaérobies et les isolats du groupe Streptococcus milleri a augmenté La ccluson K pneumoniae est devenue une cause plus fréquente d’abcès pulmonaire qu’auparavant, et une proportion élevée d’anaérobies et de S milleri des souches sont devenues résistantes à la pénicilline et à la clindamycine Un inhibiteur de la β-lactamase / β-lactamase ou une céphalosporine de deuxième ou de troisième génération associée à la clindamycine ou au métronidazole est suggéré comme traitement antibiotique empirique des abcès pulmonaires acquis dans la collectivité.

La plupart des abcès pulmonaires surviennent chez des patients présentant une prédisposition à l’aspiration et un état immunodéficitaire local ou systémique, comme une maladie pulmonaire chronique, une tumeur maligne ou un diabète sucré Les anaérobies oropharyngés et les streptocoques microaérophiles sont les pathogènes prédominants dans les abcès pulmonaires. % des cas dans les rapports publiés D’autres bactéries aérobies qui causent des abcès pulmonaires étaient beaucoup moins fréquentes Les bacilles gram négatif aérobies, souvent impliqués dans des cas d’abcès pulmonaires acquis en milieu hospitalier, étaient associés à un mauvais pronostic dans certains petits cas. études Les méthodes diagnostiques non contaminées par les bactéries colonisatrices des voies respiratoires supérieures, comme l’aspiration transtrachéale, l’aspiration pulmonaire transthoracique ou la thoracocentèse du liquide d’empyème, rendent possible l’isolement des bactéries aérobies et anaérobies Parce que l’aspiration pulmonaire transtrachéale ou transthoracique est rare. utilisé à la suite d’un manque de médecins qualifiés, abcès pulmonaires rares Ces dernières années, le problème de la résistance aux antibiotiques, y compris la résistance des bactéries anaérobies, est devenu courant. La clindamycine et la pénicilline, qui étaient auparavant le traitement standard des abcès pulmonaires bactériens anaérobies dans relativement peu d’essais cliniques […], n’ont pas Pour formuler une recommandation efficace pour un traitement empirique chez les adultes atteints d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté, en particulier chez les patients qui n’ont pas reçu de diagnostic basé sur des procédures invasives, nous avons évalué les caractéristiques épidémiologiques et la sensibilité aux antibiotiques. des résultats de tests pour des cas consécutifs, bactériologiquement confirmés d’abcès pulmonaire acquis par la communauté à travers à l’hôpital universitaire national de Taiwan Taipei, Taiwan

Patients, matériaux et méthodes

Les patients étudiés provenaient de la région de Minneapolis-St Paul, et les cas se sont produits au cours des années – Des cultures bactériologiques et des tests de sensibilité à la méthicilline ont été effectués dans les laboratoires hospitaliers admis. Les sous-cultures ont été envoyées au laboratoire Schlievert pour le superantigène Panton-Valentine leukocidin PVL testingTSST-, Les souches ont été striées dans des zones localisées sur des plaques de gélose Todd Hewitt BD et ont été cultivées pendant une nuit à ° C. Ensuite, des antisérums de lapin monospécifiques contre TSST, SEB ou SEC ont été ajoutés aux puits. Les plaques ont été incubées pendant un h supplémentaire et ont été examinées pour des lignes de précipitation indiquant l’identité immunologique des toxines produites par les souches, avec des toxines témoins purifiées ajoutées à d’autres puits adjacents. Les souches S aureus ont également été cultivées jusqu’à la phase stationnaire à ° C, en secouant dans un milieu de cœur de boeuf dialyzable qui favorise le superantig Les fluides de culture ont été traités avec des volumes d’éthanol ° C pour précipiter les superantigènes, les précipités ont été remis en suspension à% des volumes de fluide de culture d’origine, la matière insoluble a été éliminée par centrifugation et les superantigènes ont été quantifiés par immunoblot d’une comparaison de la densité de bande après le développement d’anticorps, avec des densités de bande déterminées à partir de toxines purifiées. La présence du gène PVL a été déterminée par PCR, amorce directe, ‘-GGCCTTTCCAATACAATATTGG-‘; amorce inverse, ‘-CCCAATCAACTTCATAAATTG-‘ La présence de protéine PVL a été évaluée par dosage biologique La présence de l’élément ADN de résistance à la méthicilline, mecA, a été déterminée par PCR amorce directe, ‘-GGGTACAAGATGATACC-‘; primaire inverse, ‘-GGTGCGTTAATATTGCC-‘

Résultats

Caractéristiques des patients, facteurs de risque et caractéristiques cliniques Au cours de la période d’étude, il y a eu un total de cas d’abcès pulmonaires et des cas de résultats bactériologiques documentés provenant de tissus pulmonaires, d’épanchements pleuraux ou d’hémocultures. et ont été classés comme abcès pulmonaires nosocomiaux. Les données détaillées de ces cas d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté ont été incluses dans l’analyse.Des patients atteints d’un abcès pulmonaire dû à Klebsiella pneumoniae ont eu un abcès pulmonaire récurrent dans un autre cas. Lobe pulmonaire année après l’infection initiale Les méthodes de diagnostic utilisées pour les abcès pulmonaires confirmés par bactériologie comprenaient l’aspiration transthoracique percutanée, dans les cas%; guidée par échographie dans les cas et guidée par tomodensitométrie; résultats d’hémocultures positifs, en%; résultats positifs de la culture d’épanchement pleural, en%; et examen de prélèvements chirurgicaux, en% Abcès pulmonaire unique survenant chez% des patients, et de multiples cavités observées sur les radiographies chez les patients% La plupart des patients avaient une maladie sous-jacente ou un tableau de facteurs prédisposants Une bronchoscopie était réalisée chez% des patients. malignité, y compris les patients atteints d’un carcinome bronchique; de ces patients avaient un abcès pulmonaire post-obstructif, et des cellules malignes retrouvées dans l’abcès. Quatre cas étaient de nouveaux diagnostics de cancer du poumon pendant l’hospitalisation pour abcès pulmonaire Autres tumeurs malignes n = cancer de l’œsophage n = cancer gastrique métastase n =, cancer du nasopharynx n =, et myélome multiple n =

Tableau View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients atteints d’abcès pulmonaire acquis en communautéTable View largeTélécharger les caractéristiques démographiques et cliniques des patients atteints d’abcès pulmonaire acquis dans la communautéCaractéristiques bactériologiques et relation avec les caractéristiques cliniques Au total, les pathogènes bactériens ont été récupérés sur le tableau des patients. Parmi les agents pathogènes identifiés, K pneumoniae était l’agent pathogène isolé le plus commun, suivi du groupe A de Streptococcus milleri, une proportion plus élevée de cultures pures donnait des bacilles à Gram négatif [%] de cultures et des cocci à Gram positif [%] de plus de 2% de K pneumoniae [%] et de S milleri [%] étaient aussi les agents pathogènes les plus communs chez les patients atteints d’abcès pulmonaire monobactérien. Parmi les cocci aérobies et facultatifs à Gram positif, les streptocoques viridans, en particulier le groupe S milleri, étaient les pathogènes prédominants des anaérobies, P Les espèces d’eptostreptococcus, les espèces de Prevotella et les espèces de Bacteroides ont prédominé. Les isolats des cas positifs pour la culture ont été classés dans les groupes suivants: bacilles Gram négatif aérobies purs n =; cocci gram positif aérobie ou facultatif pur n =; anaérobies purs n =; bacilles gram positifs purs n = et isolats mixtes n = Les caractéristiques cliniques des patients présentant des infections de ces catégories sont présentées dans le tableau Douze pour cent des patients présentant des expectorations putrides Les patients avec des cas du groupe pur anaérobie étaient plus susceptibles d’avoir un durée de présentation subaiguë ou chronique des symptômes présentant avant le diagnostic, & gt; jours que les autres% vs%; P & lt; Les patients ayant des cas dans la catégorie des bacilles à Gram négatif ont eu une prévalence plus élevée de cavités multiples que d’autres P & lt;

Tableau View largeTélécharger les résultats bactériologiques pour les cas d’abcès pulmonaire acquis dans la communautéTable View largeTélécharger les données bactériologiques pour les cas d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté

Tableau View largeTélécharger une diapositive Comparaison de présentations cliniques chez des patients atteints d’abcès pulmonaires communautaires, selon la classe bactériologique des pathogènes isolésTable View largeTélécharger une diapositiveComparaison de présentations cliniques chez des patients atteints d’abcès pulmonaires communautaires, selon la classe bactériologique des pathogènes isolésTest de susceptibilité La susceptibilité les données sur les bactéries anaérobies isolées chez les patients atteints d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté étaient les suivantes: pour la pénicilline,% des isolats étaient résistants et% étaient intermédiaires; pour la clindamycine,% étaient résistants et% étaient intermédiaires; pour le métronidazole,% étaient résistants et% étaient intermédiaires; pour la céfoxitine,% étaient résistants; Pour l’ampicilline-sulbactam, les isolats de K pneumoniae étaient résistants, tous étaient résistants à l’ampicilline, le% avait une résistance intermédiaire à la céfazoline, le% présentait une résistance intermédiaire à l’amoxicilline-clavulanate et tous étaient sensibles aux céphalosporines de seconde et / ou troisième génération. , gentamicine et ciprofloxacine Parmi les isolats du groupe S milleri,% étaient résistants à la clindamycine et% résistants à la pénicilline. Traitement et évolution Pour% des patients, un inhibiteur β-lactame / β-lactamase, avec ou sans gentamicine, a été utilisé Traitement empirique Dix-huit% des patients ont reçu une céphalosporine de deuxième ou troisième génération, avec ou sans gentamicine Six% ont reçu une céphalosporine de deuxième ou troisième génération, avec clindamycine ou métronidazole Quatre patients ont reçu de la clindamycine ou de la pénicilline seule Deux patients ont reçu de la pénicilline plus gentamicine Deux patients n’ont pas reçu d’antibiotiques initialement, et un patient ayant des antécédents d’allergie aux β-lactamines a reçu des fluoroquinolones et des métrones Douze% des patients ont reçu une antibiothérapie initiale inappropriée ou inadéquate, y compris des patients atteints d’une infection bactérienne anaérobie ayant reçu des céphalosporines sans activité contre les anaérobies, des patients atteints d’abcès du poumon streptococcique ayant reçu des antituberculeux seuls et des patients ayant reçu des antibiotiques empiriques sans antituberculeux. l’infection contre le pathogène isolé Nocardia asteroides infection chez les patients, et B gracilis, Pseudomonas aeruginosa, et l’infection Burkholderia pseudomallei chez le patient chaque Quatorze patients ont subi une chirurgie pour abcès pulmonaires Les résultats cliniques sont présentés dans le tableau Six des patients sont morts d’abcès pulmonaire incontrôlable

Tableau View largeTélécharger la lameComparaison des résultats pour les patients atteints d’abcès pulmonaires communautaires, selon la classe bactériologique des pathogènes isolésTable Voir grandDétaillé slideComparaison des résultats pour les patients atteints d’abcès pulmonaires communautaires, selon la classe bactériologique des pathogènes isolésComparaison entreK pneumonie et anaérobies Depuis K pneumoniae était le pathogène le plus souvent isolé dans cette étude, les caractéristiques des patients atteints d’abcès pulmonaire pur K pneumoniae ont été comparés à ceux qui ont eu des abcès pulmonaires dus à des anaérobies tabagiques Les patients atteints d’abcès pulmonaire K pneumoniae présentaient une prévalence plus élevée de diabète sucré infecté par des anaérobies% vs%; OU, ; % CI, -; P = Les groupes ne différaient pas en ce qui concerne les conditions prédisposantes sous-jacentes d’aspiration, d’alcoolisme, de malignité, de dysfonctionnement du SNC et de maladie hépatique ou rénale chronique, bien que les patients avec abcès K pneumoniae présentaient moins souvent la forme subaiguë ou chronique% vs%; OU, ; % CI, -; P = et avec crachats putrides% vs%; P & lt; , mais ils ont présenté plus souvent avec toux sèche% vs%; P & lt; En ce qui concerne les données de laboratoire, les patients présentant un abcès pulmonaire à K pneumoniae présentaient un taux supérieur de résultats d’hémocultures positifs% vs%; OU, ; % CI, -; P =, un pourcentage plus élevé de neutrophiles dans le sang périphérique signifie ° SE,% °% vs% °%; P & lt; et des taux plus élevés d’azote uréique sanguin dans le sérum signifient ° SE, ° mg / dL vs ° mg / dL; P & lt; Le niveau de créatinine ne différait pas. Sur les radiographies thoraciques, les abcès pulmonaires dus à K pneumoniae ne différaient pas en termes de localisation ou de taille de la cavité mais présentaient plus souvent des cavités multiples que les abcès pulmonaires dus aux anaérobies% vs%; OU, ; % CI, -; P = Les patients qui avaient des abcès pulmonaires à K pneumoniae présentaient une incidence plus élevée de défervescence à & gt; jours après le début de l’antibiothérapie efficace% vs%; OU, ; % CI, -; P = et étaient plus susceptibles d’avoir eu une insuffisance respiratoire ou un choc septique, mais ce dernier n’a pas été statistiquement significatif. Cette étude n’a révélé que des abcès pulmonaires et hépatiques concomitants parmi les cas d’abcès pulmonaires à K pneumoniae. K pneumoniae présenté avec le développement de la cavité après la présentation initiale de la pneumonie

Tableau View largeTélécharger slideComparaison entre les caractéristiques des patients atteints d’abcès pulmonaires dus à Klebsiella pneumoniae et ceux présentant des abcès pulmonaires dus à des anaérobiesTable View largeTélécharger slideComparaison entre les caractéristiques des patients atteints d’abcès pulmonaires dus à Klebsiella pneumoniae et ceux ayant des abcès pulmonaires dus aux anaérobies

Discussion

Des affections autres que les abcès pulmonaires à Taïwan ont été associées au diabète sucré [-,] Au cours de la période pré-antibiotique, des expectorations épaisses, de petites hémoptysies, la formation de multiples cavités à paroi mince après pneumonie aiguë ou subaiguë et des taux de mortalité élevés ont été décrits. association avec K pneumoniae abcès pulmonaire Beaucoup de patients atteints d’abcès pulmonaire K pneumoniae dans notre étude n’avaient pas d’étapes de consolidation avant la formation d’abcès La prévalence de cavités multiples avec un degré variable de pneumonite autour des cavitations dans K pneumoniae abcès pulmonaire dans notre étude Dans des études antérieures sur l’infection pulmonaire bactérienne anaérobie,% des patients étaient afébriles quelques jours après le début de l’antibiothérapie . Dans cette étude, les patients atteints d’un abcès pulmonaire à K pneumoniae étaient moins susceptibles d’avoir fièvre jours après le début du traitement que les patients atteints d’abcès du poumon dus aux anaérobies% vs%; P & lt; La résistance accrue aux antibiotiques chez les anaérobies et les isolats du groupe S milleri est une autre conclusion importante de la présente étude. La meilleure réponse au traitement et la plus grande sensibilité des anaérobies à la clindamycine qu’à la pénicilline font de la clindamycine un meilleur choix pour traiter les abcès pulmonaires anaérobies Cependant, la monothérapie à la clindamycine semble inadaptée au traitement empirique des abcès pulmonaires en raison d’un taux élevé de résistance à la clindamycine chez les pathogènes du groupe S milleri et d’une absence d’activité contre les bacilles Gram négatif obstétrique. Le matériel capsulaire produit par les pathogènes du groupe S milleri pourrait être pathogène. facteur de l’abcès pulmonaire Un pourcentage élevé de souches de S milleri résistantes à la clindamycine n’a pas été signalé auparavant Un inhibiteur β-lactamase / β-lactamase ou céphalosporine plus clindamycine ou métronidazole semble être une recommandation thérapeutique raisonnable pour un traitement empirique Récemment, des essais ont rapporté que les inhibiteurs de β-lactamines / β-lactamases ei l’ampicilline-sulbactam ou l’amoxicilline-clavulanate ont été bien tolérés et efficaces pour le traitement des pneumonies par aspiration et des abcès pulmonaires Dans cette étude, l’utilisation de l’aspiration pulmonaire transthoracique associée à la pleurocentèse et à l’hémoculture a permis d’actualiser les connaissances bactériologiques. caractéristiques de l’abcès pulmonaire acquis dans la communauté L’aspiration guidée par ultrasonographie transthoracique pour la détection des lésions pulmonaires cavitaires a été pratiquée dans notre établissement […] Dans la plupart des études bactériologiques des abcès pulmonaires, l’aspiration transtrachéale et le brossage bronchique protégé étaient les procédures les plus courantes. collection de spécimens non contaminés Deux autres études, qui ont été publiées dans le s, utilisé l’aspiration pulmonaire transthoracique percutanée pour le diagnostic microbiologique Il n’y a pas de directives pour le diagnostic des abcès pulmonaires avec des procédures invasives; cependant, la plupart des experts recommandent l’utilisation de procédures diagnostiques invasives seulement quand il n’y a pas de réponse précoce au traitement [,,] On peut isoler des agents pathogènes moins communs, comme les astéroïdes de Nocardia, Rhodococcus equi, Eikenella corrodens et certaines bactéries multirésistantes. des échantillons pulmonaires d’aspiration pulmonaire transthoracique avec succès, qui peuvent guider la thérapie antibiotique Une limitation de cette étude rétrospective est que près d’un quart des patients ont utilisé des antibiotiques pour & gt; jours avant la réalisation des cultures Certaines bactéries, en particulier les anaérobies, peuvent ne pas être isolées avec succès après l’antibiothérapie Utilisation d’antibiotiques avant l’aspiration transthoracique dans certains cas, classification des pathogènes du groupe S milleri comme «nonanaerobes» et facteurs géographiques – à savoir, que l’infection à K pneumoniae est fortement endémique à Taïwan – peut expliquer pourquoi moins d’anaérobies ont été isolés dans cette étude que dans les études rapportées dans la littérature [-,] Cependant, il n’y avait pas de différence dans la durée d’utilisation des antibiotiques. pathogène chez les patients dans les différentes catégories de bactéries Un biais de sélection dans cette étude peut avoir eu lieu, car près des deux tiers des patients ayant reçu un diagnostic d’abcès pulmonaire par système informatisé n’avaient pas de résultats d’études bactériologiques disponibles et les données de ces patients étaient exclues. conclusion, K pneumoniae devrait être considéré comme un agent étiologique possible, en plus des anaérobies, n cas d’abcès pulmonaire acquis dans la communauté chez les adultes, en particulier chez les patients diabétiques présentant une hypersensibilité, crachats non putrides, caries multiples et absence de défenses dans les jours suivant le début du traitement antimicrobien À l’ère du nombre croissant d’infections à K pneumoniae et de fortes proportions des anaérobies résistants à la pénicilline et à la clindamycine et des infections à S milleri, un inhibiteur de la β-lactamase ou de la céphalosporine de deuxième ou de troisième génération plus la clindamycine ou le métronidazole est recommandé comme traitement empirique des cas d’abcès pulmonaires acquis dans la communauté. la clindamycine seule peut ne plus convenir

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: pas de conflits

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